Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PADI3-201ENST00000375460 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CISD1-201ENST00000333926 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 WWP2-216ENST00000569174 2474 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC6A2-203ENST00000414754 3201 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CCT5P1-201ENST00000502314 1618 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF14-205ENST00000614329 2051 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF14-207ENST00000616120 2051 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02128-203ENST00000576842 2248 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SERINC1-201ENST00000339697 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 MYOZ3-201ENST00000297130 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 GFOD2-202ENST00000602279 5507 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ACTR8-201ENST00000335754 3629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 GRIA2-211ENST00000507898 3041 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 RALYL-205ENST00000521268 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFSF11-204ENST00000405262 2135 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01998-201ENST00000464673 1967 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PRPSAP1-201ENST00000324684 1678 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 C11orf49-202ENST00000378615 1651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 SLMAP-220ENST00000495364 1383 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC144CP-202ENST00000433419 5227 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 AHCYL2-208ENST00000474594 2047 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP2-2Q9BYT5 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms