Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMSN1Q9NSI8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms