Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3IPQ96QF0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3IPQ96QF0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms