Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHPRHQ149N8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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