Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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