Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms