Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK6Q00534 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms