Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC3P51654 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC3P51654 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms