Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms