Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS9P46781 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS9P46781 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS9P46781 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS9P46781 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms