Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms