Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms