Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms