Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCS1P62166 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCS1P62166 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCS1P62166 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms