Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms