Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XBP1P17861 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XBP1P17861 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XBP1P17861 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XBP1P17861 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
XBP1P17861 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XBP1P17861 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XBP1P17861 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XBP1P17861 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XBP1P17861 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms