Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-39P01597 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-39P01597 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms