Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM8AO60220 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM8AO60220 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM8AO60220 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM8AO60220 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TIMM8AO60220 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM8AO60220 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms