Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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