Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV30A0A0K0K1B3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV30A0A0K0K1B3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV30A0A0K0K1B3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV30A0A0K0K1B3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV30A0A0K0K1B3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV30A0A0K0K1B3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV30A0A0K0K1B3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV30A0A0K0K1B3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV30A0A0K0K1B3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV30A0A0K0K1B3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV30A0A0K0K1B3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV30A0A0K0K1B3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV30A0A0K0K1B3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV30A0A0K0K1B3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV30A0A0K0K1B3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV30A0A0K0K1B3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRBV30A0A0K0K1B3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRBV30A0A0K0K1B3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRBV30A0A0K0K1B3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV30A0A0K0K1B3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV30A0A0K0K1B3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV30A0A0K0K1B3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRBV30A0A0K0K1B3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRBV30A0A0K0K1B3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRBV30A0A0K0K1B3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV30A0A0K0K1B3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV30A0A0K0K1B3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRBV30A0A0K0K1B3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV30A0A0K0K1B3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV30A0A0K0K1B3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV30A0A0K0K1B3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV30A0A0K0K1B3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV30A0A0K0K1B3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV30A0A0K0K1B3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV30A0A0K0K1B3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV30A0A0K0K1B3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV30A0A0K0K1B3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV30A0A0K0K1B3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV30A0A0K0K1B3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV30A0A0K0K1B3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV30A0A0K0K1B3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV30A0A0K0K1B3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV30A0A0K0K1B3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV30A0A0K0K1B3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV30A0A0K0K1B3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV30A0A0K0K1B3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV30A0A0K0K1B3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV30A0A0K0K1B3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV30A0A0K0K1B3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV30A0A0K0K1B3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV30A0A0K0K1B3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV30A0A0K0K1B3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV30A0A0K0K1B3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRBV30A0A0K0K1B3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRBV30A0A0K0K1B3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRBV30A0A0K0K1B3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRBV30A0A0K0K1B3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRBV30A0A0K0K1B3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRBV30A0A0K0K1B3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRBV30A0A0K0K1B3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV30A0A0K0K1B3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV30A0A0K0K1B3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV30A0A0K0K1B3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRBV30A0A0K0K1B3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRBV30A0A0K0K1B3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRBV30A0A0K0K1B3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRBV30A0A0K0K1B3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRBV30A0A0K0K1B3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRBV30A0A0K0K1B3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRBV30A0A0K0K1B3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRBV30A0A0K0K1B3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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