Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms