Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GATA5Q9BWX5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GATA5Q9BWX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms