Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC71Q8IV32 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC71Q8IV32 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms