Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.581e-23■□□□□ 10
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NIPBLQ6KC79 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 9.8
NIPBLQ6KC79 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.221e-7■□□□□ 9.8
NIPBLQ6KC79 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 9.8
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NIPBLQ6KC79 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 32.18□□□□□ -2.061e-8■□□□□ 9.7
NIPBLQ6KC79 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 30.54□□□□□ -2.321e-8■□□□□ 9.7
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NIPBLQ6KC79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 9.7
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