Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC3P02656 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC3P02656 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOC3P02656 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOC3P02656 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC3P02656 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms