Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHA12Q9UN75 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms