Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 327.91■■■□□ 2.061e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.066e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.746e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.586e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.126e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.126e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 521.51■■□□□ 1.036e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 520.12■□□□□ 0.816e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.346e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 217.15■□□□□ 0.346e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 516.16■□□□□ 0.186e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 DNM1-205ENST00000463998 871 ntTSL 423.78■■□□□ 1.49e-20■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 WDR1-215ENST00000510848 554 ntTSL 425.24■■□□□ 1.635e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 WDR1-212ENST00000508949 552 ntTSL 423.27■■□□□ 1.325e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 WDR1-208ENST00000505543 687 ntTSL 420.51■□□□□ 0.875e-6■■■□□ 18
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 536.22■■■■□ 3.392e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)34.15■■■■□ 3.062e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.972e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.882e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.862e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 220.09■□□□□ 0.812e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.612e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.55e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.465e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.965e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 328.57■■■□□ 2.165e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-209ENST00000474305 1111 ntTSL 1 (best)28.38■■■□□ 2.135e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-211ENST00000546969 569 ntTSL 225.94■■□□□ 1.745e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.75e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-206ENST00000440484 781 ntTSL 422.09■■□□□ 1.135e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 CASP9-208ENST00000469637 725 ntTSL 321.73■■□□□ 1.075e-12■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.273e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-211ENST00000496873 499 ntTSL 333.85■■■■□ 3.013e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-203ENST00000438545 1025 ntTSL 533.56■■■□□ 2.963e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-206ENST00000465710 460 ntTSL 320.36■□□□□ 0.853e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-202ENST00000375403 3164 ntTSL 215.87■□□□□ 0.133e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D2-204ENST00000439909 562 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-10■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.164e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.814e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.22e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.992e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.252e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 221.26■□□□□ 0.992e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 216.92■□□□□ 0.39e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)24.21■■□□□ 1.474e-7■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 RHOA-204ENST00000431929 539 ntTSL 431.33■■■□□ 2.612e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.452e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.482e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 RHOA-205ENST00000445425 633 ntTSL 323.52■■□□□ 1.362e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 RHOA-203ENST00000422781 961 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.162e-8■■■□□ 17.9
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 336.96■■■■□ 3.512e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 431.72■■■□□ 2.672e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 430.25■■■□□ 2.432e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 223.14■■□□□ 1.292e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 221.46■■□□□ 1.032e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.766e-7■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 334.64■■■■□ 3.149e-10■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.439e-10■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 218.63■□□□□ 0.579e-10■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.539e-10■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 CHFR-218ENST00000540963 875 ntTSL 242.77■■■■■ 4.442e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-217ENST00000495731 461 ntTSL 342.26■■■■■ 4.352e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-208ENST00000483868 1720 ntTSL 542.17■■■■■ 4.342e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.212e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-228ENST00000533976 527 ntTSL 441.35■■■■■ 4.212e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-203ENST00000393400 1831 ntTSL 1 (best)41.18■■■■■ 4.182e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.12e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.012e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.952e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 239.63■■■■□ 3.932e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.762e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.722e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.392e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 RNASEH2A-203ENST00000590279 696 ntTSL 336.13■■■■□ 3.372e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 535.81■■■■□ 3.321e-11■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-225ENST00000533614 553 ntTSL 435.48■■■■□ 3.272e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.262e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 LBH-208ENST00000467242 1689 ntTSL 235.08■■■■□ 3.212e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-208ENST00000470787 1544 ntTSL 234.34■■■■□ 3.092e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-203ENST00000412341 1916 ntTSL 533.56■■■□□ 2.962e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FYTTD1-202ENST00000412924 998 ntTSL 533.3■■■□□ 2.922e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-220ENST00000496411 1064 ntTSL 332.3■■■□□ 2.762e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-224ENST00000530986 595 ntTSL 432.11■■■□□ 2.732e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 RNASEH2A-202ENST00000590121 859 ntTSL 231.34■■■□□ 2.612e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF692-219ENST00000496231 656 ntTSL 331.31■■■□□ 2.62e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FBXO3-212ENST00000533103 570 ntTSL 431.14■■■□□ 2.582e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 TPRA1-206ENST00000465915 569 ntTSL 330.83■■■□□ 2.532e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 AL591806.3-202ENST00000470694 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 230.55■■■□□ 2.482e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.452e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 FYTTD1-206ENST00000426031 491 ntTSL 330.11■■■□□ 2.412e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.392e-6■■■□□ 17.8
DROSHAQ9NRR4 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 230.01■■■□□ 2.392e-6■■■□□ 17.8
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