Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM3Q9BZL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms