Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms