Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMUB2Q71RG4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms