Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRADDQ15628 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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