Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXNP49023 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXNP49023 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXNP49023 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXNP49023 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXNP49023 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXNP49023 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXNP49023 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXNP49023 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXNP49023 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXNP49023 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PXNP49023 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PXNP49023 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms