Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms