Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms