Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBA1A5PL33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBA1A5PL33 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBA1A5PL33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms