Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRBV24-1A0A075B6N3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRBV24-1A0A075B6N3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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