Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAB39Q9Y376 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAB39Q9Y376 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAB39Q9Y376 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAB39Q9Y376 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms