Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCE1Q9Y256 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCE1Q9Y256 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCE1Q9Y256 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCE1Q9Y256 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms