Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQK1

PPP1R3C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3CQ9UQK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3CQ9UQK1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R3CQ9UQK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3CQ9UQK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3CQ9UQK1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3CQ9UQK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3CQ9UQK1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3CQ9UQK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms