Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHOC2Q9UQ13 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SHOC2Q9UQ13 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHOC2Q9UQ13 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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