Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW0

FOXJ3, Forkhead box protein J3, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ3Q9UPW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ3Q9UPW0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ3Q9UPW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXJ3Q9UPW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXJ3Q9UPW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms