Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL4Q9UJQ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SALL4Q9UJQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL4Q9UJQ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL4Q9UJQ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL4Q9UJQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms