Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP25Q9UHP3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP25Q9UHP3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP25Q9UHP3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP25Q9UHP3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP25Q9UHP3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms