Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1BQ9UEU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1BQ9UEU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1BQ9UEU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms