Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP28Q9P2N2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP28Q9P2N2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP28Q9P2N2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms