Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MBD5Q9P267 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
MBD5Q9P267 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
MBD5Q9P267 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
MBD5Q9P267 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
MBD5Q9P267 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
MBD5Q9P267 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MBD5Q9P267 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
MBD5Q9P267 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
MBD5Q9P267 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms