Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA13Q9P0J0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA13Q9P0J0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFA13Q9P0J0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA13Q9P0J0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA13Q9P0J0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms