Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC59Q9P031 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC59Q9P031 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC59Q9P031 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC59Q9P031 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1650.7 ms