Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALKBH4Q9NXW9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALKBH4Q9NXW9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALKBH4Q9NXW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALKBH4Q9NXW9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms