Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK13-1Q9NX77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK13-1Q9NX77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVK13-1Q9NX77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms